Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLL3

Tnfrsf19, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 19, mousemouse

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf19Q9JLL3 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms