Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Mrpl39Q9JKF7 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Mrpl39Q9JKF7 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Mrpl39Q9JKF7 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Mrpl39Q9JKF7 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Mrpl39Q9JKF7 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
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