Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
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Cldn12Q9ET43 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
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