Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK4

Cse1l, Exportin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cse1lQ9ERK4 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cse1lQ9ERK4 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cse1lQ9ERK4 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cse1lQ9ERK4 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cse1lQ9ERK4 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cse1lQ9ERK4 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cse1lQ9ERK4 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cse1lQ9ERK4 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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