Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAK3

Rhobtb1, Rho-related BTB domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb1Q9DAK3 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhobtb1Q9DAK3 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhobtb1Q9DAK3 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhobtb1Q9DAK3 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhobtb1Q9DAK3 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhobtb1Q9DAK3 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhobtb1Q9DAK3 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhobtb1Q9DAK3 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhobtb1Q9DAK3 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhobtb1Q9DAK3 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhobtb1Q9DAK3 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhobtb1Q9DAK3 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhobtb1Q9DAK3 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhobtb1Q9DAK3 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhobtb1Q9DAK3 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhobtb1Q9DAK3 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhobtb1Q9DAK3 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhobtb1Q9DAK3 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhobtb1Q9DAK3 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhobtb1Q9DAK3 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhobtb1Q9DAK3 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhobtb1Q9DAK3 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhobtb1Q9DAK3 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhobtb1Q9DAK3 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhobtb1Q9DAK3 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhobtb1Q9DAK3 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhobtb1Q9DAK3 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhobtb1Q9DAK3 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhobtb1Q9DAK3 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhobtb1Q9DAK3 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhobtb1Q9DAK3 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhobtb1Q9DAK3 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhobtb1Q9DAK3 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhobtb1Q9DAK3 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhobtb1Q9DAK3 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhobtb1Q9DAK3 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhobtb1Q9DAK3 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhobtb1Q9DAK3 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhobtb1Q9DAK3 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhobtb1Q9DAK3 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhobtb1Q9DAK3 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhobtb1Q9DAK3 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhobtb1Q9DAK3 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhobtb1Q9DAK3 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhobtb1Q9DAK3 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhobtb1Q9DAK3 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhobtb1Q9DAK3 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhobtb1Q9DAK3 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhobtb1Q9DAK3 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhobtb1Q9DAK3 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhobtb1Q9DAK3 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhobtb1Q9DAK3 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhobtb1Q9DAK3 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhobtb1Q9DAK3 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhobtb1Q9DAK3 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhobtb1Q9DAK3 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhobtb1Q9DAK3 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhobtb1Q9DAK3 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhobtb1Q9DAK3 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhobtb1Q9DAK3 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhobtb1Q9DAK3 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rhobtb1Q9DAK3 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rhobtb1Q9DAK3 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rhobtb1Q9DAK3 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rhobtb1Q9DAK3 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rhobtb1Q9DAK3 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rhobtb1Q9DAK3 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rhobtb1Q9DAK3 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rhobtb1Q9DAK3 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rhobtb1Q9DAK3 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rhobtb1Q9DAK3 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rhobtb1Q9DAK3 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rhobtb1Q9DAK3 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rhobtb1Q9DAK3 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rhobtb1Q9DAK3 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rhobtb1Q9DAK3 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rhobtb1Q9DAK3 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
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Rhobtb1Q9DAK3 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rhobtb1Q9DAK3 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rhobtb1Q9DAK3 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rhobtb1Q9DAK3 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rhobtb1Q9DAK3 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rhobtb1Q9DAK3 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rhobtb1Q9DAK3 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rhobtb1Q9DAK3 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rhobtb1Q9DAK3 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rhobtb1Q9DAK3 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rhobtb1Q9DAK3 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rhobtb1Q9DAK3 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rhobtb1Q9DAK3 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rhobtb1Q9DAK3 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rhobtb1Q9DAK3 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rhobtb1Q9DAK3 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhobtb1Q9DAK3 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhobtb1Q9DAK3 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhobtb1Q9DAK3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhobtb1Q9DAK3 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhobtb1Q9DAK3 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhobtb1Q9DAK3 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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