Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D9

Uncharacterized protein C1orf189 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9D9 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D9D9 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D9D9 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D9D9 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D9D9 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D9D9 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D9D9 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D9D9 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D9D9 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D9D9 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D9D9 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D9D9 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D9D9 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D9D9 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D9D9 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D9D9 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D9D9 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D9D9 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D9D9 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D9D9 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D9D9 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D9D9 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D9D9 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D9D9 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D9D9 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D9D9 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D9D9 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D9D9 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D9D9 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D9D9 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D9D9 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D9D9 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D9D9 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D9D9 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D9D9 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D9D9 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D9D9 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D9D9 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D9D9 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D9D9 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D9D9 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D9D9 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D9D9 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D9D9 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D9D9 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D9D9 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D9D9 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D9D9 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D9D9 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D9D9 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D9D9 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D9D9 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D9D9 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D9D9 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9D9D9 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9D9D9 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9D9D9 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9D9D9 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9D9D9 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9D9D9 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9D9D9 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9D9D9 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9D9D9 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9D9D9 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9D9D9 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9D9D9 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9D9D9 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9D9D9 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Q9D9D9 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9D9D9 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9D9D9 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9D9D9 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9D9D9 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9D9D9 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9D9D9 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9D9D9 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9D9D9 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9D9D9 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9D9D9 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9D9D9 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9D9D9 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9D9D9 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9D9D9 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9D9D9 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9D9D9 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9D9D9 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9D9D9 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9D9D9 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9D9D9 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9D9D9 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9D9D9 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9D9D9 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9D9D9 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9D9D9 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9D9D9 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.3 ms