Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Capns2Q9D7J7 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Capns2Q9D7J7 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Capns2Q9D7J7 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Capns2Q9D7J7 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Capns2Q9D7J7 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Capns2Q9D7J7 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Capns2Q9D7J7 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Capns2Q9D7J7 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Capns2Q9D7J7 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Capns2Q9D7J7 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Capns2Q9D7J7 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Capns2Q9D7J7 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capns2Q9D7J7 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capns2Q9D7J7 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capns2Q9D7J7 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capns2Q9D7J7 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capns2Q9D7J7 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capns2Q9D7J7 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capns2Q9D7J7 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capns2Q9D7J7 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capns2Q9D7J7 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capns2Q9D7J7 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capns2Q9D7J7 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capns2Q9D7J7 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capns2Q9D7J7 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capns2Q9D7J7 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms