Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms