Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D1

Rnf225, RING finger protein 225, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf225Q9D7D1 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf225Q9D7D1 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf225Q9D7D1 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf225Q9D7D1 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf225Q9D7D1 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf225Q9D7D1 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf225Q9D7D1 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf225Q9D7D1 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf225Q9D7D1 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf225Q9D7D1 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf225Q9D7D1 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf225Q9D7D1 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf225Q9D7D1 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf225Q9D7D1 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf225Q9D7D1 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf225Q9D7D1 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf225Q9D7D1 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf225Q9D7D1 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf225Q9D7D1 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf225Q9D7D1 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf225Q9D7D1 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf225Q9D7D1 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf225Q9D7D1 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf225Q9D7D1 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf225Q9D7D1 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf225Q9D7D1 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf225Q9D7D1 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf225Q9D7D1 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf225Q9D7D1 Il6-204ENSMUST00000199765 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf225Q9D7D1 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf225Q9D7D1 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf225Q9D7D1 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf225Q9D7D1 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf225Q9D7D1 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf225Q9D7D1 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf225Q9D7D1 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf225Q9D7D1 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf225Q9D7D1 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf225Q9D7D1 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf225Q9D7D1 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf225Q9D7D1 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf225Q9D7D1 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf225Q9D7D1 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf225Q9D7D1 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf225Q9D7D1 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf225Q9D7D1 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf225Q9D7D1 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf225Q9D7D1 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf225Q9D7D1 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf225Q9D7D1 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf225Q9D7D1 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf225Q9D7D1 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf225Q9D7D1 Gm6681-201ENSMUST00000205215 607 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf225Q9D7D1 Olfr258-ps1-202ENSMUST00000218625 1085 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf225Q9D7D1 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf225Q9D7D1 Olfr1152-201ENSMUST00000051058 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf225Q9D7D1 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf225Q9D7D1 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf225Q9D7D1 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf225Q9D7D1 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf225Q9D7D1 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf225Q9D7D1 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf225Q9D7D1 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf225Q9D7D1 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf225Q9D7D1 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf225Q9D7D1 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf225Q9D7D1 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf225Q9D7D1 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf225Q9D7D1 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf225Q9D7D1 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf225Q9D7D1 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf225Q9D7D1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf225Q9D7D1 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf225Q9D7D1 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf225Q9D7D1 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf225Q9D7D1 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf225Q9D7D1 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf225Q9D7D1 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf225Q9D7D1 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf225Q9D7D1 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf225Q9D7D1 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf225Q9D7D1 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf225Q9D7D1 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf225Q9D7D1 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf225Q9D7D1 Gm2087-201ENSMUST00000188217 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf225Q9D7D1 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf225Q9D7D1 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf225Q9D7D1 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf225Q9D7D1 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf225Q9D7D1 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf225Q9D7D1 Speer4c-201ENSMUST00000095005 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf225Q9D7D1 Speer4d-201ENSMUST00000095006 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf225Q9D7D1 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf225Q9D7D1 Trappc3l-201ENSMUST00000095758 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf225Q9D7D1 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf225Q9D7D1 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf225Q9D7D1 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf225Q9D7D1 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf225Q9D7D1 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf225Q9D7D1 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms