Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6I0

Rtl8c, Cxx1c protein, mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rtl8cQ9D6I0 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rtl8cQ9D6I0 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rtl8cQ9D6I0 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rtl8cQ9D6I0 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rtl8cQ9D6I0 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rtl8cQ9D6I0 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rtl8cQ9D6I0 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rtl8cQ9D6I0 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rtl8cQ9D6I0 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rtl8cQ9D6I0 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rtl8cQ9D6I0 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rtl8cQ9D6I0 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rtl8cQ9D6I0 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rtl8cQ9D6I0 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rtl8cQ9D6I0 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rtl8cQ9D6I0 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rtl8cQ9D6I0 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Rtl8cQ9D6I0 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rtl8cQ9D6I0 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rtl8cQ9D6I0 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rtl8cQ9D6I0 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rtl8cQ9D6I0 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rtl8cQ9D6I0 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rtl8cQ9D6I0 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rtl8cQ9D6I0 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rtl8cQ9D6I0 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rtl8cQ9D6I0 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Rtl8cQ9D6I0 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rtl8cQ9D6I0 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rtl8cQ9D6I0 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rtl8cQ9D6I0 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Rtl8cQ9D6I0 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rtl8cQ9D6I0 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rtl8cQ9D6I0 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rtl8cQ9D6I0 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Rtl8cQ9D6I0 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rtl8cQ9D6I0 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rtl8cQ9D6I0 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rtl8cQ9D6I0 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rtl8cQ9D6I0 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Rtl8cQ9D6I0 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Rtl8cQ9D6I0 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rtl8cQ9D6I0 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Rtl8cQ9D6I0 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rtl8cQ9D6I0 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Rtl8cQ9D6I0 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rtl8cQ9D6I0 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Rtl8cQ9D6I0 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Rtl8cQ9D6I0 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Rtl8cQ9D6I0 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rtl8cQ9D6I0 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rtl8cQ9D6I0 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rtl8cQ9D6I0 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rtl8cQ9D6I0 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rtl8cQ9D6I0 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rtl8cQ9D6I0 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rtl8cQ9D6I0 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rtl8cQ9D6I0 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rtl8cQ9D6I0 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rtl8cQ9D6I0 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rtl8cQ9D6I0 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rtl8cQ9D6I0 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rtl8cQ9D6I0 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rtl8cQ9D6I0 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rtl8cQ9D6I0 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rtl8cQ9D6I0 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rtl8cQ9D6I0 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rtl8cQ9D6I0 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rtl8cQ9D6I0 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Rtl8cQ9D6I0 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rtl8cQ9D6I0 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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