Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms