Protein–RNA interactions for Protein: Q9D548

Zcchc13, Cellular nucleic acid binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc13Q9D548 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms