Protein–RNA interactions for Protein: Q9D534

Zc2hc1b, Zinc finger C2HC domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc2hc1bQ9D534 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Zc2hc1bQ9D534 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Zc2hc1bQ9D534 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Zc2hc1bQ9D534 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Zc2hc1bQ9D534 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Zc2hc1bQ9D534 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Zc2hc1bQ9D534 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Zc2hc1bQ9D534 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Zc2hc1bQ9D534 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Zc2hc1bQ9D534 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Zc2hc1bQ9D534 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Zc2hc1bQ9D534 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Zc2hc1bQ9D534 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Zc2hc1bQ9D534 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Zc2hc1bQ9D534 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Zc2hc1bQ9D534 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Zc2hc1bQ9D534 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Zc2hc1bQ9D534 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Zc2hc1bQ9D534 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Zc2hc1bQ9D534 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Zc2hc1bQ9D534 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Zc2hc1bQ9D534 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Zc2hc1bQ9D534 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Zc2hc1bQ9D534 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Zc2hc1bQ9D534 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Zc2hc1bQ9D534 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Zc2hc1bQ9D534 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Zc2hc1bQ9D534 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Zc2hc1bQ9D534 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Zc2hc1bQ9D534 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Zc2hc1bQ9D534 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zc2hc1bQ9D534 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zc2hc1bQ9D534 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zc2hc1bQ9D534 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zc2hc1bQ9D534 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zc2hc1bQ9D534 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zc2hc1bQ9D534 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zc2hc1bQ9D534 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zc2hc1bQ9D534 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zc2hc1bQ9D534 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zc2hc1bQ9D534 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zc2hc1bQ9D534 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zc2hc1bQ9D534 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zc2hc1bQ9D534 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zc2hc1bQ9D534 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zc2hc1bQ9D534 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zc2hc1bQ9D534 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zc2hc1bQ9D534 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zc2hc1bQ9D534 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Zc2hc1bQ9D534 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zc2hc1bQ9D534 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zc2hc1bQ9D534 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zc2hc1bQ9D534 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zc2hc1bQ9D534 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Zc2hc1bQ9D534 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zc2hc1bQ9D534 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zc2hc1bQ9D534 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zc2hc1bQ9D534 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zc2hc1bQ9D534 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zc2hc1bQ9D534 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zc2hc1bQ9D534 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zc2hc1bQ9D534 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zc2hc1bQ9D534 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zc2hc1bQ9D534 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zc2hc1bQ9D534 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zc2hc1bQ9D534 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zc2hc1bQ9D534 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zc2hc1bQ9D534 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Zc2hc1bQ9D534 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Zc2hc1bQ9D534 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Zc2hc1bQ9D534 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Zc2hc1bQ9D534 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Zc2hc1bQ9D534 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Zc2hc1bQ9D534 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Zc2hc1bQ9D534 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Zc2hc1bQ9D534 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Zc2hc1bQ9D534 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Zc2hc1bQ9D534 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Zc2hc1bQ9D534 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Zc2hc1bQ9D534 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Zc2hc1bQ9D534 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Zc2hc1bQ9D534 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Zc2hc1bQ9D534 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Zc2hc1bQ9D534 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Zc2hc1bQ9D534 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Zc2hc1bQ9D534 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Zc2hc1bQ9D534 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Zc2hc1bQ9D534 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Zc2hc1bQ9D534 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Zc2hc1bQ9D534 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Zc2hc1bQ9D534 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Zc2hc1bQ9D534 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Zc2hc1bQ9D534 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Zc2hc1bQ9D534 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Zc2hc1bQ9D534 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Zc2hc1bQ9D534 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Zc2hc1bQ9D534 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Zc2hc1bQ9D534 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Zc2hc1bQ9D534 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Zc2hc1bQ9D534 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms