Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms