Protein–RNA interactions for Protein: Q9D454

Uncharacterized protein CXorf49 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D454 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D454 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D454 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D454 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D454 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D454 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D454 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D454 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D454 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D454 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D454 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D454 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D454 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D454 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D454 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D454 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D454 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D454 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D454 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D454 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D454 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D454 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D454 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D454 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D454 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D454 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D454 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D454 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D454 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D454 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D454 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D454 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D454 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D454 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D454 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D454 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D454 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D454 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D454 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D454 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D454 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D454 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D454 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D454 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D454 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D454 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D454 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D454 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D454 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D454 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D454 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D454 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D454 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D454 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D454 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D454 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D454 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D454 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D454 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D454 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D454 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D454 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D454 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D454 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D454 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D454 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D454 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D454 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D454 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D454 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D454 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D454 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D454 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D454 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D454 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D454 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D454 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D454 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D454 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D454 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D454 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D454 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D454 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D454 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D454 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D454 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D454 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D454 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D454 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D454 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D454 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D454 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D454 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D454 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D454 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D454 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D454 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D454 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D454 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D454 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms