Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X4

4933428G20Rik, RIKEN cDNA 4933428G20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428G20RikQ9D3X4 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Ar-201ENSMUST00000052837 10048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Pcdhb19-201ENSMUST00000059571 7138 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Gcc2-201ENSMUST00000057659 6547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Tmc3-201ENSMUST00000039317 6221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Sec22c-201ENSMUST00000078547 5713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Bicral-201ENSMUST00000040624 6579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms