Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M1

Prpsap1, Phosphoribosyl pyrophosphate synthase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpsap1Q9D0M1 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prpsap1Q9D0M1 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prpsap1Q9D0M1 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prpsap1Q9D0M1 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prpsap1Q9D0M1 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prpsap1Q9D0M1 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prpsap1Q9D0M1 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prpsap1Q9D0M1 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Prpsap1Q9D0M1 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prpsap1Q9D0M1 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpsap1Q9D0M1 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpsap1Q9D0M1 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpsap1Q9D0M1 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpsap1Q9D0M1 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpsap1Q9D0M1 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpsap1Q9D0M1 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpsap1Q9D0M1 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpsap1Q9D0M1 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpsap1Q9D0M1 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpsap1Q9D0M1 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpsap1Q9D0M1 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpsap1Q9D0M1 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpsap1Q9D0M1 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpsap1Q9D0M1 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpsap1Q9D0M1 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpsap1Q9D0M1 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpsap1Q9D0M1 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpsap1Q9D0M1 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpsap1Q9D0M1 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpsap1Q9D0M1 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpsap1Q9D0M1 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpsap1Q9D0M1 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpsap1Q9D0M1 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpsap1Q9D0M1 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpsap1Q9D0M1 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpsap1Q9D0M1 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prpsap1Q9D0M1 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prpsap1Q9D0M1 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prpsap1Q9D0M1 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prpsap1Q9D0M1 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prpsap1Q9D0M1 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prpsap1Q9D0M1 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prpsap1Q9D0M1 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prpsap1Q9D0M1 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prpsap1Q9D0M1 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prpsap1Q9D0M1 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prpsap1Q9D0M1 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prpsap1Q9D0M1 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prpsap1Q9D0M1 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prpsap1Q9D0M1 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prpsap1Q9D0M1 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prpsap1Q9D0M1 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prpsap1Q9D0M1 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Prpsap1Q9D0M1 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Prpsap1Q9D0M1 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prpsap1Q9D0M1 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prpsap1Q9D0M1 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prpsap1Q9D0M1 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prpsap1Q9D0M1 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prpsap1Q9D0M1 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prpsap1Q9D0M1 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prpsap1Q9D0M1 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prpsap1Q9D0M1 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prpsap1Q9D0M1 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prpsap1Q9D0M1 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prpsap1Q9D0M1 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prpsap1Q9D0M1 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prpsap1Q9D0M1 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prpsap1Q9D0M1 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prpsap1Q9D0M1 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prpsap1Q9D0M1 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpsap1Q9D0M1 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpsap1Q9D0M1 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpsap1Q9D0M1 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpsap1Q9D0M1 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpsap1Q9D0M1 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpsap1Q9D0M1 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpsap1Q9D0M1 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpsap1Q9D0M1 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpsap1Q9D0M1 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpsap1Q9D0M1 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpsap1Q9D0M1 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpsap1Q9D0M1 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpsap1Q9D0M1 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpsap1Q9D0M1 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpsap1Q9D0M1 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpsap1Q9D0M1 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpsap1Q9D0M1 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpsap1Q9D0M1 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpsap1Q9D0M1 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpsap1Q9D0M1 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpsap1Q9D0M1 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpsap1Q9D0M1 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpsap1Q9D0M1 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpsap1Q9D0M1 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpsap1Q9D0M1 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpsap1Q9D0M1 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpsap1Q9D0M1 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpsap1Q9D0M1 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpsap1Q9D0M1 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms