Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gtf2e1Q9D0D5 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms