Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms