Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9CRC3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9CRC3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Q9CRC3 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9CRC3 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9CRC3 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9CRC3 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Q9CRC3 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Q9CRC3 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Q9CRC3 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Q9CRC3 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Q9CRC3 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Q9CRC3 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Q9CRC3 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Q9CRC3 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9CRC3 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9CRC3 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms