Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA1

Trappc5, Trafficking protein particle complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc5Q9CQA1 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Trappc5Q9CQA1 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Trappc5Q9CQA1 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc5Q9CQA1 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Trappc5Q9CQA1 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Trappc5Q9CQA1 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc5Q9CQA1 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Trappc5Q9CQA1 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc5Q9CQA1 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Trappc5Q9CQA1 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc5Q9CQA1 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc5Q9CQA1 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc5Q9CQA1 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc5Q9CQA1 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc5Q9CQA1 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc5Q9CQA1 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc5Q9CQA1 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc5Q9CQA1 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc5Q9CQA1 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc5Q9CQA1 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Trappc5Q9CQA1 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
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