Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms