Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPW7

Zmat2, Zinc finger matrin-type protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zmat2Q9CPW7 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zmat2Q9CPW7 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zmat2Q9CPW7 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Zmat2Q9CPW7 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zmat2Q9CPW7 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zmat2Q9CPW7 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zmat2Q9CPW7 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Zmat2Q9CPW7 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Zmat2Q9CPW7 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zmat2Q9CPW7 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zmat2Q9CPW7 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zmat2Q9CPW7 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zmat2Q9CPW7 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zmat2Q9CPW7 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zmat2Q9CPW7 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zmat2Q9CPW7 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zmat2Q9CPW7 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zmat2Q9CPW7 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Zmat2Q9CPW7 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zmat2Q9CPW7 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zmat2Q9CPW7 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zmat2Q9CPW7 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zmat2Q9CPW7 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zmat2Q9CPW7 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zmat2Q9CPW7 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zmat2Q9CPW7 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zmat2Q9CPW7 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zmat2Q9CPW7 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zmat2Q9CPW7 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zmat2Q9CPW7 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zmat2Q9CPW7 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zmat2Q9CPW7 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zmat2Q9CPW7 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zmat2Q9CPW7 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zmat2Q9CPW7 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zmat2Q9CPW7 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zmat2Q9CPW7 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zmat2Q9CPW7 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zmat2Q9CPW7 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zmat2Q9CPW7 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zmat2Q9CPW7 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zmat2Q9CPW7 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zmat2Q9CPW7 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zmat2Q9CPW7 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zmat2Q9CPW7 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zmat2Q9CPW7 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zmat2Q9CPW7 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zmat2Q9CPW7 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zmat2Q9CPW7 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zmat2Q9CPW7 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zmat2Q9CPW7 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zmat2Q9CPW7 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zmat2Q9CPW7 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zmat2Q9CPW7 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zmat2Q9CPW7 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zmat2Q9CPW7 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zmat2Q9CPW7 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zmat2Q9CPW7 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zmat2Q9CPW7 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zmat2Q9CPW7 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zmat2Q9CPW7 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zmat2Q9CPW7 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zmat2Q9CPW7 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zmat2Q9CPW7 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zmat2Q9CPW7 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Zmat2Q9CPW7 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Zmat2Q9CPW7 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zmat2Q9CPW7 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zmat2Q9CPW7 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Zmat2Q9CPW7 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zmat2Q9CPW7 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zmat2Q9CPW7 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zmat2Q9CPW7 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zmat2Q9CPW7 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zmat2Q9CPW7 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zmat2Q9CPW7 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zmat2Q9CPW7 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zmat2Q9CPW7 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zmat2Q9CPW7 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zmat2Q9CPW7 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zmat2Q9CPW7 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zmat2Q9CPW7 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zmat2Q9CPW7 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zmat2Q9CPW7 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zmat2Q9CPW7 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zmat2Q9CPW7 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zmat2Q9CPW7 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zmat2Q9CPW7 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zmat2Q9CPW7 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zmat2Q9CPW7 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zmat2Q9CPW7 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Zmat2Q9CPW7 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zmat2Q9CPW7 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zmat2Q9CPW7 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zmat2Q9CPW7 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zmat2Q9CPW7 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zmat2Q9CPW7 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zmat2Q9CPW7 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zmat2Q9CPW7 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Zmat2Q9CPW7 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms