Protein–RNA interactions for Protein: Q99P25

Tsnaxip1, Translin-associated factor X-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsnaxip1Q99P25 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tsnaxip1Q99P25 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms