Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hdac9Q99N13 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hdac9Q99N13 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hdac9Q99N13 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Hdac9Q99N13 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hdac9Q99N13 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hdac9Q99N13 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hdac9Q99N13 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hdac9Q99N13 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hdac9Q99N13 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hdac9Q99N13 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Hdac9Q99N13 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hdac9Q99N13 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hdac9Q99N13 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hdac9Q99N13 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hdac9Q99N13 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hdac9Q99N13 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hdac9Q99N13 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hdac9Q99N13 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hdac9Q99N13 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hdac9Q99N13 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hdac9Q99N13 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms