Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PtprtQ99M80 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PtprtQ99M80 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtprtQ99M80 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtprtQ99M80 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtprtQ99M80 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PtprtQ99M80 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtprtQ99M80 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PtprtQ99M80 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtprtQ99M80 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtprtQ99M80 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtprtQ99M80 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtprtQ99M80 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtprtQ99M80 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtprtQ99M80 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PtprtQ99M80 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtprtQ99M80 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
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PtprtQ99M80 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtprtQ99M80 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtprtQ99M80 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtprtQ99M80 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PtprtQ99M80 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtprtQ99M80 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtprtQ99M80 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtprtQ99M80 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtprtQ99M80 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtprtQ99M80 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtprtQ99M80 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtprtQ99M80 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtprtQ99M80 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtprtQ99M80 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtprtQ99M80 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtprtQ99M80 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PtprtQ99M80 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
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PtprtQ99M80 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PtprtQ99M80 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PtprtQ99M80 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PtprtQ99M80 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PtprtQ99M80 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PtprtQ99M80 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PtprtQ99M80 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PtprtQ99M80 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PtprtQ99M80 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PtprtQ99M80 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
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PtprtQ99M80 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PtprtQ99M80 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PtprtQ99M80 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PtprtQ99M80 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PtprtQ99M80 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PtprtQ99M80 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PtprtQ99M80 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
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PtprtQ99M80 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PtprtQ99M80 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PtprtQ99M80 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
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PtprtQ99M80 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
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PtprtQ99M80 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PtprtQ99M80 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PtprtQ99M80 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PtprtQ99M80 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
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PtprtQ99M80 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PtprtQ99M80 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PtprtQ99M80 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PtprtQ99M80 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
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PtprtQ99M80 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
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PtprtQ99M80 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PtprtQ99M80 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
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PtprtQ99M80 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PtprtQ99M80 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PtprtQ99M80 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PtprtQ99M80 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PtprtQ99M80 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PtprtQ99M80 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PtprtQ99M80 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PtprtQ99M80 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PtprtQ99M80 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PtprtQ99M80 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtprtQ99M80 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtprtQ99M80 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtprtQ99M80 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
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