Protein–RNA interactions for Protein: Q99LF4

Rtcb, tRNA-splicing ligase RtcB homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtcbQ99LF4 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RtcbQ99LF4 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RtcbQ99LF4 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RtcbQ99LF4 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RtcbQ99LF4 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RtcbQ99LF4 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RtcbQ99LF4 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RtcbQ99LF4 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RtcbQ99LF4 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RtcbQ99LF4 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RtcbQ99LF4 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RtcbQ99LF4 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RtcbQ99LF4 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RtcbQ99LF4 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RtcbQ99LF4 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RtcbQ99LF4 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RtcbQ99LF4 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RtcbQ99LF4 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RtcbQ99LF4 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RtcbQ99LF4 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RtcbQ99LF4 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RtcbQ99LF4 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RtcbQ99LF4 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RtcbQ99LF4 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RtcbQ99LF4 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RtcbQ99LF4 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RtcbQ99LF4 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RtcbQ99LF4 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RtcbQ99LF4 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RtcbQ99LF4 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RtcbQ99LF4 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RtcbQ99LF4 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RtcbQ99LF4 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RtcbQ99LF4 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RtcbQ99LF4 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RtcbQ99LF4 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RtcbQ99LF4 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RtcbQ99LF4 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RtcbQ99LF4 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RtcbQ99LF4 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RtcbQ99LF4 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RtcbQ99LF4 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RtcbQ99LF4 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RtcbQ99LF4 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RtcbQ99LF4 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RtcbQ99LF4 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RtcbQ99LF4 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RtcbQ99LF4 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RtcbQ99LF4 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RtcbQ99LF4 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RtcbQ99LF4 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RtcbQ99LF4 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RtcbQ99LF4 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RtcbQ99LF4 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RtcbQ99LF4 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RtcbQ99LF4 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RtcbQ99LF4 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RtcbQ99LF4 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RtcbQ99LF4 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RtcbQ99LF4 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RtcbQ99LF4 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RtcbQ99LF4 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RtcbQ99LF4 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RtcbQ99LF4 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RtcbQ99LF4 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RtcbQ99LF4 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RtcbQ99LF4 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RtcbQ99LF4 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RtcbQ99LF4 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RtcbQ99LF4 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RtcbQ99LF4 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RtcbQ99LF4 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RtcbQ99LF4 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RtcbQ99LF4 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RtcbQ99LF4 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RtcbQ99LF4 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RtcbQ99LF4 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RtcbQ99LF4 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RtcbQ99LF4 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RtcbQ99LF4 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RtcbQ99LF4 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RtcbQ99LF4 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RtcbQ99LF4 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RtcbQ99LF4 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RtcbQ99LF4 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RtcbQ99LF4 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RtcbQ99LF4 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RtcbQ99LF4 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RtcbQ99LF4 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RtcbQ99LF4 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RtcbQ99LF4 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RtcbQ99LF4 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RtcbQ99LF4 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RtcbQ99LF4 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RtcbQ99LF4 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RtcbQ99LF4 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RtcbQ99LF4 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RtcbQ99LF4 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RtcbQ99LF4 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RtcbQ99LF4 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms