Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms