Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Rab28Q99KL7 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Rab28Q99KL7 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Rab28Q99KL7 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Rab28Q99KL7 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Rab28Q99KL7 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Rab28Q99KL7 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Rab28Q99KL7 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Rab28Q99KL7 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Rab28Q99KL7 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Rab28Q99KL7 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Rab28Q99KL7 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Rab28Q99KL7 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Rab28Q99KL7 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Rab28Q99KL7 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rab28Q99KL7 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rab28Q99KL7 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
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