Protein–RNA interactions for Protein: Q99KK1

Reep3, Receptor expression-enhancing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep3Q99KK1 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms