Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms