Protein–RNA interactions for Protein: Q924Y0

Bbox1, Gamma-butyrobetaine dioxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbox1Q924Y0 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bbox1Q924Y0 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bbox1Q924Y0 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bbox1Q924Y0 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bbox1Q924Y0 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bbox1Q924Y0 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bbox1Q924Y0 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bbox1Q924Y0 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bbox1Q924Y0 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bbox1Q924Y0 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bbox1Q924Y0 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bbox1Q924Y0 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bbox1Q924Y0 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bbox1Q924Y0 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bbox1Q924Y0 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bbox1Q924Y0 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bbox1Q924Y0 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bbox1Q924Y0 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bbox1Q924Y0 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bbox1Q924Y0 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bbox1Q924Y0 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bbox1Q924Y0 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bbox1Q924Y0 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bbox1Q924Y0 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bbox1Q924Y0 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Bbox1Q924Y0 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bbox1Q924Y0 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bbox1Q924Y0 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bbox1Q924Y0 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bbox1Q924Y0 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bbox1Q924Y0 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bbox1Q924Y0 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bbox1Q924Y0 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bbox1Q924Y0 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bbox1Q924Y0 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bbox1Q924Y0 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bbox1Q924Y0 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bbox1Q924Y0 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bbox1Q924Y0 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Bbox1Q924Y0 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bbox1Q924Y0 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bbox1Q924Y0 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bbox1Q924Y0 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bbox1Q924Y0 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bbox1Q924Y0 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bbox1Q924Y0 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bbox1Q924Y0 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bbox1Q924Y0 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bbox1Q924Y0 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bbox1Q924Y0 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bbox1Q924Y0 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bbox1Q924Y0 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Bbox1Q924Y0 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bbox1Q924Y0 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bbox1Q924Y0 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bbox1Q924Y0 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bbox1Q924Y0 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bbox1Q924Y0 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bbox1Q924Y0 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bbox1Q924Y0 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bbox1Q924Y0 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bbox1Q924Y0 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bbox1Q924Y0 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bbox1Q924Y0 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bbox1Q924Y0 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bbox1Q924Y0 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Bbox1Q924Y0 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Bbox1Q924Y0 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Bbox1Q924Y0 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Bbox1Q924Y0 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Bbox1Q924Y0 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bbox1Q924Y0 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bbox1Q924Y0 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bbox1Q924Y0 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bbox1Q924Y0 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bbox1Q924Y0 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bbox1Q924Y0 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bbox1Q924Y0 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bbox1Q924Y0 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bbox1Q924Y0 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bbox1Q924Y0 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bbox1Q924Y0 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bbox1Q924Y0 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bbox1Q924Y0 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Bbox1Q924Y0 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bbox1Q924Y0 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bbox1Q924Y0 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bbox1Q924Y0 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bbox1Q924Y0 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bbox1Q924Y0 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Bbox1Q924Y0 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bbox1Q924Y0 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bbox1Q924Y0 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bbox1Q924Y0 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bbox1Q924Y0 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bbox1Q924Y0 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bbox1Q924Y0 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bbox1Q924Y0 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bbox1Q924Y0 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bbox1Q924Y0 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms