Protein–RNA interactions for Protein: Q923Z4

Ferd3l, Fer3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ferd3lQ923Z4 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ferd3lQ923Z4 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ferd3lQ923Z4 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ferd3lQ923Z4 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ferd3lQ923Z4 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ferd3lQ923Z4 AC160966.1-203ENSMUST00000214689 1186 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ferd3lQ923Z4 RMST_1.1-204ENSMUST00000217871 699 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ferd3lQ923Z4 AC173482.3-201ENSMUST00000225492 1212 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ferd3lQ923Z4 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ferd3lQ923Z4 Gm5605-201ENSMUST00000208940 1305 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ferd3lQ923Z4 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ferd3lQ923Z4 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ferd3lQ923Z4 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ferd3lQ923Z4 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ferd3lQ923Z4 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ferd3lQ923Z4 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ferd3lQ923Z4 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ferd3lQ923Z4 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ferd3lQ923Z4 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ferd3lQ923Z4 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ferd3lQ923Z4 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ferd3lQ923Z4 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ferd3lQ923Z4 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ferd3lQ923Z4 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ferd3lQ923Z4 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ferd3lQ923Z4 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ferd3lQ923Z4 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ferd3lQ923Z4 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ferd3lQ923Z4 E130114P18Rik-201ENSMUST00000107067 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ferd3lQ923Z4 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ferd3lQ923Z4 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ferd3lQ923Z4 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ferd3lQ923Z4 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ferd3lQ923Z4 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ferd3lQ923Z4 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ferd3lQ923Z4 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ferd3lQ923Z4 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ferd3lQ923Z4 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ferd3lQ923Z4 AC096628.1-201ENSMUST00000226060 641 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ferd3lQ923Z4 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ferd3lQ923Z4 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ferd3lQ923Z4 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ferd3lQ923Z4 Gm45114-201ENSMUST00000208280 1349 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ferd3lQ923Z4 Eif3s6-ps4-201ENSMUST00000202873 1388 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ferd3lQ923Z4 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ferd3lQ923Z4 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ferd3lQ923Z4 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ferd3lQ923Z4 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ferd3lQ923Z4 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ferd3lQ923Z4 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ferd3lQ923Z4 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ferd3lQ923Z4 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ferd3lQ923Z4 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ferd3lQ923Z4 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ferd3lQ923Z4 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ferd3lQ923Z4 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ferd3lQ923Z4 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ferd3lQ923Z4 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ferd3lQ923Z4 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ferd3lQ923Z4 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ferd3lQ923Z4 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ferd3lQ923Z4 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ferd3lQ923Z4 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ferd3lQ923Z4 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ferd3lQ923Z4 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ferd3lQ923Z4 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ferd3lQ923Z4 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ferd3lQ923Z4 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ferd3lQ923Z4 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ferd3lQ923Z4 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ferd3lQ923Z4 Gm11948-201ENSMUST00000142322 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ferd3lQ923Z4 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ferd3lQ923Z4 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ferd3lQ923Z4 Mnd1-ps-201ENSMUST00000162462 604 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ferd3lQ923Z4 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ferd3lQ923Z4 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ferd3lQ923Z4 Olfr181-203ENSMUST00000205742 1104 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ferd3lQ923Z4 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ferd3lQ923Z4 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ferd3lQ923Z4 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ferd3lQ923Z4 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ferd3lQ923Z4 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ferd3lQ923Z4 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ferd3lQ923Z4 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ferd3lQ923Z4 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ferd3lQ923Z4 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ferd3lQ923Z4 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ferd3lQ923Z4 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ferd3lQ923Z4 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ferd3lQ923Z4 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ferd3lQ923Z4 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ferd3lQ923Z4 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ferd3lQ923Z4 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ferd3lQ923Z4 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ferd3lQ923Z4 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ferd3lQ923Z4 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ferd3lQ923Z4 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ferd3lQ923Z4 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ferd3lQ923Z4 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ferd3lQ923Z4 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms