Protein–RNA interactions for Protein: Q91W40

Klc3, Kinesin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc3Q91W40 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klc3Q91W40 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klc3Q91W40 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Klc3Q91W40 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klc3Q91W40 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klc3Q91W40 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klc3Q91W40 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klc3Q91W40 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klc3Q91W40 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Klc3Q91W40 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klc3Q91W40 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klc3Q91W40 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klc3Q91W40 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klc3Q91W40 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klc3Q91W40 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klc3Q91W40 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klc3Q91W40 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klc3Q91W40 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klc3Q91W40 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klc3Q91W40 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klc3Q91W40 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klc3Q91W40 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klc3Q91W40 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Klc3Q91W40 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Klc3Q91W40 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Klc3Q91W40 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Klc3Q91W40 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Klc3Q91W40 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Klc3Q91W40 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Klc3Q91W40 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Klc3Q91W40 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Klc3Q91W40 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Klc3Q91W40 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Klc3Q91W40 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Klc3Q91W40 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Klc3Q91W40 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Klc3Q91W40 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Klc3Q91W40 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Klc3Q91W40 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms