Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Gm37592-201ENSMUST00000192741 373 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Gm37083-201ENSMUST00000195784 711 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp3Q91W36 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms