Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ9

Vps4a, Vacuolar protein sorting-associated protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps4aQ8VEJ9 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps4aQ8VEJ9 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps4aQ8VEJ9 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps4aQ8VEJ9 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps4aQ8VEJ9 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps4aQ8VEJ9 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps4aQ8VEJ9 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps4aQ8VEJ9 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps4aQ8VEJ9 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps4aQ8VEJ9 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps4aQ8VEJ9 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps4aQ8VEJ9 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps4aQ8VEJ9 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps4aQ8VEJ9 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps4aQ8VEJ9 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps4aQ8VEJ9 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps4aQ8VEJ9 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps4aQ8VEJ9 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps4aQ8VEJ9 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps4aQ8VEJ9 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps4aQ8VEJ9 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps4aQ8VEJ9 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps4aQ8VEJ9 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps4aQ8VEJ9 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps4aQ8VEJ9 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps4aQ8VEJ9 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps4aQ8VEJ9 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps4aQ8VEJ9 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps4aQ8VEJ9 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps4aQ8VEJ9 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps4aQ8VEJ9 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps4aQ8VEJ9 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps4aQ8VEJ9 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps4aQ8VEJ9 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps4aQ8VEJ9 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps4aQ8VEJ9 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps4aQ8VEJ9 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vps4aQ8VEJ9 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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