Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD72

Ttc8, Tetratricopeptide repeat protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc8Q8VD72 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttc8Q8VD72 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ttc8Q8VD72 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ttc8Q8VD72 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc8Q8VD72 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc8Q8VD72 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc8Q8VD72 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc8Q8VD72 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc8Q8VD72 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc8Q8VD72 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc8Q8VD72 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc8Q8VD72 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc8Q8VD72 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc8Q8VD72 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc8Q8VD72 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc8Q8VD72 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc8Q8VD72 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc8Q8VD72 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc8Q8VD72 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc8Q8VD72 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc8Q8VD72 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc8Q8VD72 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc8Q8VD72 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc8Q8VD72 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc8Q8VD72 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc8Q8VD72 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc8Q8VD72 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttc8Q8VD72 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc8Q8VD72 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc8Q8VD72 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc8Q8VD72 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc8Q8VD72 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc8Q8VD72 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc8Q8VD72 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc8Q8VD72 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc8Q8VD72 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc8Q8VD72 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc8Q8VD72 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc8Q8VD72 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc8Q8VD72 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc8Q8VD72 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc8Q8VD72 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc8Q8VD72 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc8Q8VD72 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc8Q8VD72 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc8Q8VD72 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc8Q8VD72 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc8Q8VD72 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc8Q8VD72 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc8Q8VD72 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc8Q8VD72 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc8Q8VD72 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc8Q8VD72 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc8Q8VD72 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc8Q8VD72 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc8Q8VD72 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc8Q8VD72 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc8Q8VD72 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc8Q8VD72 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc8Q8VD72 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc8Q8VD72 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc8Q8VD72 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc8Q8VD72 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc8Q8VD72 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc8Q8VD72 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc8Q8VD72 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc8Q8VD72 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc8Q8VD72 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc8Q8VD72 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Ttc8Q8VD72 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc8Q8VD72 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc8Q8VD72 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc8Q8VD72 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc8Q8VD72 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc8Q8VD72 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc8Q8VD72 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttc8Q8VD72 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttc8Q8VD72 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttc8Q8VD72 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttc8Q8VD72 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttc8Q8VD72 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttc8Q8VD72 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttc8Q8VD72 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttc8Q8VD72 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttc8Q8VD72 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttc8Q8VD72 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttc8Q8VD72 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttc8Q8VD72 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttc8Q8VD72 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttc8Q8VD72 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttc8Q8VD72 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttc8Q8VD72 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttc8Q8VD72 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttc8Q8VD72 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttc8Q8VD72 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttc8Q8VD72 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttc8Q8VD72 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttc8Q8VD72 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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