Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBZ3

Clptm1, Cleft lip and palate transmembrane protein 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clptm1Q8VBZ3 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms