Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms