Protein–RNA interactions for Protein: Q8R332

Nup58, Nucleoporin p58/p45, mousemouse

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Length 587 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup58Q8R332 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Nup58Q8R332 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup58Q8R332 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup58Q8R332 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup58Q8R332 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup58Q8R332 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup58Q8R332 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup58Q8R332 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
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Nup58Q8R332 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Nup58Q8R332 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nup58Q8R332 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nup58Q8R332 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nup58Q8R332 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nup58Q8R332 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nup58Q8R332 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nup58Q8R332 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup58Q8R332 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup58Q8R332 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup58Q8R332 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Nup58Q8R332 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup58Q8R332 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Nup58Q8R332 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Nup58Q8R332 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Nup58Q8R332 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup58Q8R332 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Nup58Q8R332 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup58Q8R332 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Nup58Q8R332 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Nup58Q8R332 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Nup58Q8R332 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Nup58Q8R332 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Nup58Q8R332 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup58Q8R332 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Nup58Q8R332 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup58Q8R332 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup58Q8R332 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup58Q8R332 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup58Q8R332 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup58Q8R332 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup58Q8R332 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup58Q8R332 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup58Q8R332 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup58Q8R332 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup58Q8R332 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup58Q8R332 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup58Q8R332 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup58Q8R332 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup58Q8R332 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup58Q8R332 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup58Q8R332 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup58Q8R332 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms