Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3P5

Cnot6, CCR4-NOT transcription complex subunit 6, mousemouse

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Length 557 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot6Q8K3P5 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot6Q8K3P5 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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