Protein–RNA interactions for Protein: Q8K342

Rassf9, Ras association domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf9Q8K342 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rassf9Q8K342 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rassf9Q8K342 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rassf9Q8K342 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rassf9Q8K342 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rassf9Q8K342 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rassf9Q8K342 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rassf9Q8K342 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rassf9Q8K342 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rassf9Q8K342 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rassf9Q8K342 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rassf9Q8K342 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rassf9Q8K342 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rassf9Q8K342 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rassf9Q8K342 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rassf9Q8K342 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rassf9Q8K342 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rassf9Q8K342 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rassf9Q8K342 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rassf9Q8K342 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rassf9Q8K342 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rassf9Q8K342 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rassf9Q8K342 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rassf9Q8K342 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rassf9Q8K342 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rassf9Q8K342 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rassf9Q8K342 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rassf9Q8K342 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rassf9Q8K342 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rassf9Q8K342 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rassf9Q8K342 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rassf9Q8K342 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rassf9Q8K342 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rassf9Q8K342 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rassf9Q8K342 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rassf9Q8K342 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rassf9Q8K342 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rassf9Q8K342 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rassf9Q8K342 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rassf9Q8K342 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rassf9Q8K342 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rassf9Q8K342 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rassf9Q8K342 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rassf9Q8K342 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rassf9Q8K342 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rassf9Q8K342 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rassf9Q8K342 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rassf9Q8K342 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rassf9Q8K342 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rassf9Q8K342 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rassf9Q8K342 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rassf9Q8K342 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rassf9Q8K342 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rassf9Q8K342 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rassf9Q8K342 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rassf9Q8K342 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rassf9Q8K342 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rassf9Q8K342 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rassf9Q8K342 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rassf9Q8K342 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rassf9Q8K342 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rassf9Q8K342 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rassf9Q8K342 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rassf9Q8K342 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rassf9Q8K342 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rassf9Q8K342 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rassf9Q8K342 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rassf9Q8K342 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rassf9Q8K342 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rassf9Q8K342 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rassf9Q8K342 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rassf9Q8K342 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rassf9Q8K342 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rassf9Q8K342 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rassf9Q8K342 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rassf9Q8K342 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rassf9Q8K342 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rassf9Q8K342 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rassf9Q8K342 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rassf9Q8K342 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rassf9Q8K342 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rassf9Q8K342 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Rassf9Q8K342 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rassf9Q8K342 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rassf9Q8K342 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rassf9Q8K342 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rassf9Q8K342 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rassf9Q8K342 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rassf9Q8K342 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rassf9Q8K342 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rassf9Q8K342 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rassf9Q8K342 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rassf9Q8K342 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rassf9Q8K342 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rassf9Q8K342 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rassf9Q8K342 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rassf9Q8K342 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rassf9Q8K342 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rassf9Q8K342 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rassf9Q8K342 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms