Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y9

Ccm2, Cerebral cavernous malformations protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccm2Q8K2Y9 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccm2Q8K2Y9 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccm2Q8K2Y9 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccm2Q8K2Y9 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccm2Q8K2Y9 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccm2Q8K2Y9 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccm2Q8K2Y9 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccm2Q8K2Y9 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccm2Q8K2Y9 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccm2Q8K2Y9 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccm2Q8K2Y9 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccm2Q8K2Y9 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccm2Q8K2Y9 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccm2Q8K2Y9 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccm2Q8K2Y9 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccm2Q8K2Y9 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccm2Q8K2Y9 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccm2Q8K2Y9 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccm2Q8K2Y9 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccm2Q8K2Y9 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccm2Q8K2Y9 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccm2Q8K2Y9 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccm2Q8K2Y9 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccm2Q8K2Y9 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccm2Q8K2Y9 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccm2Q8K2Y9 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccm2Q8K2Y9 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccm2Q8K2Y9 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccm2Q8K2Y9 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccm2Q8K2Y9 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccm2Q8K2Y9 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccm2Q8K2Y9 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccm2Q8K2Y9 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccm2Q8K2Y9 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccm2Q8K2Y9 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccm2Q8K2Y9 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccm2Q8K2Y9 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccm2Q8K2Y9 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccm2Q8K2Y9 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccm2Q8K2Y9 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccm2Q8K2Y9 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccm2Q8K2Y9 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccm2Q8K2Y9 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccm2Q8K2Y9 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccm2Q8K2Y9 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccm2Q8K2Y9 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccm2Q8K2Y9 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccm2Q8K2Y9 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccm2Q8K2Y9 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccm2Q8K2Y9 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccm2Q8K2Y9 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccm2Q8K2Y9 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccm2Q8K2Y9 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccm2Q8K2Y9 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccm2Q8K2Y9 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccm2Q8K2Y9 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccm2Q8K2Y9 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccm2Q8K2Y9 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccm2Q8K2Y9 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccm2Q8K2Y9 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccm2Q8K2Y9 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccm2Q8K2Y9 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccm2Q8K2Y9 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccm2Q8K2Y9 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccm2Q8K2Y9 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccm2Q8K2Y9 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccm2Q8K2Y9 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccm2Q8K2Y9 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccm2Q8K2Y9 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccm2Q8K2Y9 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccm2Q8K2Y9 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccm2Q8K2Y9 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccm2Q8K2Y9 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccm2Q8K2Y9 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccm2Q8K2Y9 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccm2Q8K2Y9 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccm2Q8K2Y9 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccm2Q8K2Y9 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccm2Q8K2Y9 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccm2Q8K2Y9 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccm2Q8K2Y9 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccm2Q8K2Y9 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccm2Q8K2Y9 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccm2Q8K2Y9 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccm2Q8K2Y9 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccm2Q8K2Y9 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccm2Q8K2Y9 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccm2Q8K2Y9 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccm2Q8K2Y9 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccm2Q8K2Y9 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccm2Q8K2Y9 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccm2Q8K2Y9 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccm2Q8K2Y9 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccm2Q8K2Y9 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccm2Q8K2Y9 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccm2Q8K2Y9 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccm2Q8K2Y9 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccm2Q8K2Y9 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccm2Q8K2Y9 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccm2Q8K2Y9 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms