Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

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Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Abcf3Q8K268 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Abcf3Q8K268 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Abcf3Q8K268 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Abcf3Q8K268 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Abcf3Q8K268 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
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Abcf3Q8K268 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Abcf3Q8K268 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Abcf3Q8K268 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Abcf3Q8K268 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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