Protein–RNA interactions for Protein: Q8K158

Cnppd1, Protein CNPPD1, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnppd1Q8K158 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnppd1Q8K158 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnppd1Q8K158 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnppd1Q8K158 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnppd1Q8K158 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnppd1Q8K158 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnppd1Q8K158 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnppd1Q8K158 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnppd1Q8K158 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnppd1Q8K158 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnppd1Q8K158 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnppd1Q8K158 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnppd1Q8K158 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnppd1Q8K158 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnppd1Q8K158 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnppd1Q8K158 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnppd1Q8K158 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnppd1Q8K158 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnppd1Q8K158 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnppd1Q8K158 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnppd1Q8K158 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnppd1Q8K158 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnppd1Q8K158 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnppd1Q8K158 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnppd1Q8K158 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnppd1Q8K158 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnppd1Q8K158 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnppd1Q8K158 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnppd1Q8K158 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnppd1Q8K158 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnppd1Q8K158 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnppd1Q8K158 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnppd1Q8K158 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnppd1Q8K158 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnppd1Q8K158 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnppd1Q8K158 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnppd1Q8K158 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnppd1Q8K158 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnppd1Q8K158 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnppd1Q8K158 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnppd1Q8K158 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnppd1Q8K158 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnppd1Q8K158 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnppd1Q8K158 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnppd1Q8K158 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnppd1Q8K158 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnppd1Q8K158 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnppd1Q8K158 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnppd1Q8K158 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnppd1Q8K158 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnppd1Q8K158 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnppd1Q8K158 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnppd1Q8K158 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnppd1Q8K158 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnppd1Q8K158 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnppd1Q8K158 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnppd1Q8K158 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnppd1Q8K158 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnppd1Q8K158 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnppd1Q8K158 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnppd1Q8K158 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnppd1Q8K158 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnppd1Q8K158 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnppd1Q8K158 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnppd1Q8K158 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnppd1Q8K158 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnppd1Q8K158 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnppd1Q8K158 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnppd1Q8K158 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnppd1Q8K158 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnppd1Q8K158 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnppd1Q8K158 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnppd1Q8K158 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnppd1Q8K158 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnppd1Q8K158 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnppd1Q8K158 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnppd1Q8K158 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnppd1Q8K158 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnppd1Q8K158 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnppd1Q8K158 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnppd1Q8K158 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnppd1Q8K158 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnppd1Q8K158 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnppd1Q8K158 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnppd1Q8K158 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnppd1Q8K158 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnppd1Q8K158 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnppd1Q8K158 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnppd1Q8K158 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnppd1Q8K158 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnppd1Q8K158 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnppd1Q8K158 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnppd1Q8K158 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnppd1Q8K158 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnppd1Q8K158 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnppd1Q8K158 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Cnppd1Q8K158 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnppd1Q8K158 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnppd1Q8K158 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnppd1Q8K158 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms