Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFT2

Setd1b, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd1bQ8CFT2 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
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Setd1bQ8CFT2 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Setd1bQ8CFT2 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Setd1bQ8CFT2 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Setd1bQ8CFT2 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Setd1bQ8CFT2 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Setd1bQ8CFT2 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
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Setd1bQ8CFT2 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Setd1bQ8CFT2 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
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Setd1bQ8CFT2 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Setd1bQ8CFT2 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Setd1bQ8CFT2 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
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Setd1bQ8CFT2 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
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Setd1bQ8CFT2 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Setd1bQ8CFT2 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Setd1bQ8CFT2 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Setd1bQ8CFT2 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Setd1bQ8CFT2 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Setd1bQ8CFT2 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Setd1bQ8CFT2 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
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Setd1bQ8CFT2 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Setd1bQ8CFT2 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
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Setd1bQ8CFT2 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
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Setd1bQ8CFT2 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Setd1bQ8CFT2 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Setd1bQ8CFT2 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Setd1bQ8CFT2 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Setd1bQ8CFT2 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
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Setd1bQ8CFT2 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
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Setd1bQ8CFT2 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Setd1bQ8CFT2 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Setd1bQ8CFT2 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Setd1bQ8CFT2 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
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Setd1bQ8CFT2 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
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Setd1bQ8CFT2 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
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Setd1bQ8CFT2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
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Setd1bQ8CFT2 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Setd1bQ8CFT2 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Setd1bQ8CFT2 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Setd1bQ8CFT2 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Setd1bQ8CFT2 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Setd1bQ8CFT2 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Setd1bQ8CFT2 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Setd1bQ8CFT2 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Setd1bQ8CFT2 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Setd1bQ8CFT2 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Setd1bQ8CFT2 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Setd1bQ8CFT2 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Setd1bQ8CFT2 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Setd1bQ8CFT2 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Setd1bQ8CFT2 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Setd1bQ8CFT2 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Setd1bQ8CFT2 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Setd1bQ8CFT2 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Setd1bQ8CFT2 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
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Setd1bQ8CFT2 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Setd1bQ8CFT2 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Setd1bQ8CFT2 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
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Setd1bQ8CFT2 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Setd1bQ8CFT2 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
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