Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDE2

Ccin, Calicin, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcinQ8CDE2 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms