Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC35

Synpo, Synaptopodin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 929 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynpoQ8CC35 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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