Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBF3

Ephb1, Ephrin type-B receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb1Q8CBF3 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ephb1Q8CBF3 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms