Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBD1

Nrip1, Nuclear receptor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip1Q8CBD1 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nrip1Q8CBD1 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms